Hallo Gina,
richtig - das Theme für die Gestaltung der Website gilt "normal" immer für die ganze Website. Wenn du ein eigenes Hosting hast, kannst du dir als Admin ein anderes Theme installieren oder über Designeinstellungen die Gestaltung verändern. Dort kannst du dann auch für einzelne Kursbereiche, Kurse oder Nutzer verschiedene Themes hinterlegen. Macht aber selten wirklich Sinn.
Aktuell wird noch eine Vorversion der in diesem Beitrag verwendeten Preset-Datei verwendet: https://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=401751
Viele Grüße
Dag