Yo mismo me responderé, he conseguido solucionar el problema cambiando los nombres de las reglas CSS. Algunas de estas reglas tenían el mismo nombre que las de la hoja CSS general de la plataforma. Por esto existía un conflicto entre ambas hojas de estilos.
Tema solucionado,
Un saludo.
Problemas Generales
Problema con CSS en Moodle
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