Hola Mayra,
Yo usé hace mucho ese módulo, tan sólo por curioso.
Creo que sí hace lo que quieres, pero que más bien tendrás que instalarlo y
ver si es así.
Mil disculpas por no poder darte más información
Sin embargo, me da la impresión que puedes usar las dos aplicaciones como
"front".
Es decir, si le das la dirección a alguien para que entre por Joomla,
pues entrará por ahí, aunque ello no excluye que le puedas proporcionar
el URI de Moodle.
Yo creo que si instalas tu servidor con Joomla en la carpeta principal
de tu servidor (sea www o htdocs), y Moodle en un subfólder, (digamos
www/moodle o htdocs/moodle), pues como que forzarás a que
Joomla sea el "front".
En fin, es sólo una idea.
Saludos