Creo que en general, Moodle no es un sustituto de las clases presenciales sino que es un excelente complemento.
Como cualquier herramienta hay que reconocer tanto sus ventajas (que son evidentes) como sus limitaciones.
Mi recomendacion es utilizarlo como su creador lo plantea: como un complemento de las clases presenciales.
(Es el caso, que yo lo aplico en estudiantes de licenciatura, de la Facultad de Arquitectura, de la Universidad Nacional Autónoma de Mexico, en las materias de Geometria II y III (3º y 4º semestre).