ご助言ありがとうございます。
config の設定、オーナーおよびパーミッションは、両サーバで同じでした。
$CFG->dataroot = '/opt/bitnami/apps/moodle/moodledata';
drwxrwsr-x 12 bitnami daemon 4096 Aug 17 07:20 moodledata
drwxrwsr-x 12 bitnami daemon 4096 Aug 17 17:20 moodledata
bitnami ユーザの cron を無効にして
root ユーザの cron に内容を複写することで
admin/cron.php が定期的に実行できることは確認したのですが、
できれば、原因を明確にして
bitnami ユーザの cron で正常処理できるように修正したいとおもっています。