Hola Pablo... yo he tenido ese problema. Lo primero que se me ocurrió fue salvar el curso: probá incluir en la copia todo el curso MENOS los archivos de los alumnos. Si eso te funciona, te está dando problemas algun archivo q que subieron: revisá cuales son los mas grandes en tamaño, bajalos aparte y borralos; y fijate los nombres: los que tengan nombres largos o con caracteres o acentos, cambiales el nombre.
Si no te funciona, es alguna actividad, empezá sacando los foros (por los adjuntos). Tratá de descubrir qué es lo que te está dando el problema. Para mí: algun archivo grande, peli, adjunto, o algo que no reconoce (algun cruci, flash).
A mi me pasa eso por tiempo: me queda la pantalla en blanco y encima genera una copia que es falsa, no sirve para reusar. Tené cuidado. Y cuando sepas lo que falla, encontramos la solucion !!!