Ja, ist möglich. Zur Sicherheit bitte eine Sicherung der Datenbank durchführen. Dann einfach das alte moodle-Verzeichnis umbenennen. Anschließend die neue Version hochladen und die config.php aus dem alten in das neue Verzeichnis kopieren.
Danach .../moodle/admin/index.php aufrufen und die Aktualisierung sollte durchgeführt werden.