Mylla Rayane,
Eu sei que é um pouco tarde, mas tive este problema agora.
Fiz todas as configurações de conclusão de atividade e rastreamento, o aluno completava as atividades e no relatório de Andamento do Curso não aparecia que o curso estava concluído.
Só consegui fazer ele ficar concluído depois que coloquei o cron para rodar de tempos em tempos.
(Para configurar o cron utilize este post: https://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=126488)
