В файле это не указывается, позже в процессе загрузки в форме выберите, кому нужно менять пароли:
Можно ли заранее прописать в moodle настройки импорта, чтобы при очередной загрузке не выбирать их из списка, где нибудь в таблице может поле есть?
Например "Тип загрузки" чтобы по умолчанию был установлен на "Добавить новых и пропустить имеющихся"
p.s.
Пока вышел из ситуации редактированием файла user_form.php, где прописал выбор по умолчанию в нужных полях