Bueno, lo cierto es que estaba hablando por hablar, no creí que fueras a estar tan convencido.. :D
La verdad es que los sistemas biométricos son sistema de control bastante avanzados, que generalmente necesitan de aplicaciones externas para su funcionamiento.
Para Moodle no he encontrado nada concreto, pero buscando un poco, hay proyectos como este:
http://www.gts.tsc.uvigo.es/web/imaxes_user/070609010644_swb2007_oteromuras_et_al.pdf
Es de la universidad de Vigo, y se basa en aplicar las técnicas de biometría para la autenticación web, usando Java. El documento est´á en inglés, y por lo que he podido leer se apoya en el protocolo CAS de autenticación para autenticar al usuario en el sistema mediante un aplicación externa.
Hay una versión beta, probada satisfactoriamente con Moodle según mencionan en el documento, en
http://sourceforge.net/projects/biowebauth/
Sería algo así como arrancar el navegador para entrar en moodle, pero a la vez arrancar este llama a una aplicación externa que efectua la autenticación y la envía al servidor de autenticación biométrica, donde se guardan los datos suministrados por los usuarios. A continuación se realiza otra petición al servidor CAS, el cual realiza la comprobación de los datos habituales y los biométricos, y envía de vuelta al navegador, la confirmación o denegación de acceso para el usuario. El tema es complicado, pero interesante.
En mi opinión, lo ideal sería crear un módulo integral o modificar el proceso de login de Moodle, y que mediante una webcam por ejemplo, registrara tu rostro y comprobara que efectivamente eres tú quien está frente al ordenador. La otra opción son los lectores de huellas digitales, algo más caros que las webcams pero requieren menos ancho de banda. Pero en este caso, la taera sobrepasa las posibilidades de PHP, y necesitarías implementar dicha solución en otros lenguajes como Java (un applet), Python, C# o similar.
Por cierto, encontré
este hilo en inglés, sobre el tema. Es corto pero puede darte una idea de si realmente es necesario usar estos sistemas con Moodle.