Gracias Eduardo por tu pronta respuesta,
Mira el archivo de configuración es el siguiente:
<?php /// Moodle Configuration File
unset($CFG);
$CFG->dbtype = 'mysql';
$CFG->dbhost = 'lotus.myserver.com
$CFG->dbname = 'moodle';
$CFG->dbuser = 'moodle_admin';
$CFG->dbpass = 'mipass';
$CFG->dbpersist = false;
$CFG->prefix = 'mdl_';
$CFG->wwwroot = 'http://www.mysitio.com
$CFG->dirroot = '/hsphere/local/home/virtualw/mysitio.com';
$CFG->dataroot = '/hsphere/local/home/virtualw/mysitio.com/datoscursos';
$CFG->admin = 'admin';
$CFG->directorypermissions = 00777; // try 02777 on a server in Safe Mode
$CFG->respectsessionsettings = 'true';
require_once("$CFG->dirroot/lib/setup.php");
// MAKE SURE WHEN YOU EDIT THIS FILE THAT THERE ARE NO SPACES, BLANK LINES,
// RETURNS, OR ANYTHING ELSE AFTER THE TWO CHARACTERS ON THE NEXT LINE.
?>
Sobre los permisos los cambié en todas las subcarpetas del archivo de datos pero funciona un rato y a parecer si se crea un curso nuevo se le cambian los permisos y ya no deja subir archivos
El Linux si está en producción y tengo muchos problemas por ello pues hay cursos muy importantes que están en marcha.
Se puso lento después de la actualización.