Lo primero, gracias por tu respuesta.
Yo creo que sí pasa solo... Y por otra parte ya hice copias de seguridad, que como se guardan en la carpeta "moodledata" también se borraron. Ahora ya se que el sistema de archivos de Moodle no es fiable y que todas las copias de seguridad las bajaré a mi máquinas.
Saludos!!!