Hola Octavio,
Es complicado responder a tus preguntas porque eso depende de cómo tengas estructurado tu sistema de copias de seguridad.
En mi caso, por ejemplo, utilizo la copia de seguridad de toda la plataforma, y las hago con bastante frecuencia.
Por tanto, en los cursos no necesito tener copias de seguridad incluyendo usuarios y demás. Únicamente hago copia del material didáctico de los cursos y, como no cambia con frecuencia, la copia de éstos la tengo deshabilitada ya que la hago manualmente una sola vez y la actualizo en caso necesario.
Un saludo,
JP