Todos los hostings tienen limites en los envios de correo. Dudo mucho que ese nivel de envios se considere SPAM.
De todas formas, un hosting con esos limites es realmente penoso asi que la decision seria cambiar de hosting.
Si eso no es posible, utiliza GMail (https://docs.moodle.org/32/en/Email_setup_gmail) o busca otro servidor externo como Postmarkapp o MailGun.