La verdad es que yo soy más partidario de lo que propone Miguel Ángel: "clonar" el curso.
El original (que mantiene todos los datos) se oculta aunque no se borre durante cierto tiempo, se hace un "backup" y al restaurar como nuevo curso, simplemente decir que ignore todos los datos de los usuarios para que quede totalmente "limpio".
Eso tiene una ventaja añadida y es que si había fechas de entrega de tareas, cuestionarios, etc., dichas fechas se actualizarán automáticamente cuando indiquemos la "fecha de inicio" (en el proceso de restauración).
Pero bueno, si prefieres usar la opción de "Reiniciar", fíjate que hay muchas opciones para indicar qué cosas quieres que se eliminen ... lo normal sería marcar que elimine todo, supongo. Pero ahí mismo puedes quitar los alumnos antiguos:
Saludos.