Hola Daniel,
Para Moodle 2.9.x se recomienda utilizar Mysql 5.5.31, Postgres SQL 9.1, MariaDB 5.5.31, SQL Server 2008 u Oracle Database 10.2
Aquí tienes la referencia: https://docs.moodle.org/all/es/Notas_de_Moodle_2.9#Requisitos_de_la_BasedeDatos
Suerte.
JP