Il plugin Book lo trovi all'interno dei pacchetti che puoi scaricare da moodle.org:
La cartella dove cercarlo è la cartella "mod". Occhio alla release, può essere l'occasione per aggiornare l'intera installazione di Moodle alla più recente weekly build.
Sul discorso plugin book obsoleto e conservazione dei dati, puoi provare a vedere se il modulo più recente riesce ad aggiornare il modulo obsoleto. Ti consiglio caldamente di effettuare questo tipo di prove su un ambiente di test e controllarne gli esiti prima di effettuarle sul tuo sito in produzione.