Если нужно поправить ссылки на картинки в ответах, то я бы сделал это прямо в БД в таблице mdl_question_answers (поиск /id_курса1/папка/ и замена на /id_курса2/папка/)
Пожалуй это самое правильно решение в данном случае. А еще этого позволит выявить курсы с вопросам имеющие ссылки на другие курсы!