Hola Yolanda.
Estoy totalmente seguro que este error se debe a que tu sitio Moodle está en un servidor totalmente sobrecargado, de manera que cuando se hace una petición a la base de datos se produce un tiempo de demora tan elevado que salta el error de acceso (este problema ya lo he vivido personalmente).
Lo peor es que cuando tengas varios alumnos accediendo a los mismos recursos que ahora te cuesta subir, el problema será más grave.
Por otra parte, te recomendaría que abandonaras Moodle 2.0 y pasaras a Moodle 2.2, ya que fue 2.0 fue una versión puente y me temo que muchas cosas no está muy pulidas.
Si quieres hacer pruebas en un servidor con la versión 2.2 no tengo inconveniente en dejarte unos días un espacio en el mío y así te aseguras que este es el problema.
Puedes mandarme un mail a tyfconsulting@hotmail.com y lo hablamos.
Un saludo