Muchas gracias a todos por las resupuestas. Aún no me he decantado por ninguna solución, pero vuestras aportaciones me han servido para plantearme varias opciones.
Yo había pensado también incluir Moodle dentro de Joomla, gracias al plugin Joomdle (ya he trabajado con él y funciona bastante bien la integración). Con ello consigo tener el gestor documental de Joomla que me proporciona todo lo que necesito sin realizar nada de programación.
Ya os contaré al final por lo que me he decantado.
Gracias, Rebeca.