Muchas gracias Javier,
Ya solucioné el problema, efectivamente, tenia mal escrito el comando para correr el cron.php., sin embargo aun no logro que lleguen los correos a los usuarios de la plataforma.
En alguna documentacion de MoodleDocs, lei que el sistema de correos ya viene habilitado por default, pero no se que me falta configurar.
Saludos!