Nuevos Módulos, Apariencia y Personalización

Ahi ya descubrí como hacerlo con un simple plugins. Funciona de maravilla:
https://moodle.org/plugins/local_boostnavigation
Con este plugin podes ocultar cosas del menú sin tener que tocar nada de php ni css, además te permite meter nuevos enlaces personalizados. Justo lo que necesitaba