Hola, Iván.
Creo que no exactamente como tú lo has entendido, aunque no me pidas muchas más explicaciones porque tampoco soy experto en eso
Pero creo que al poner "localhost" estás indicando que ese usuario está definido en el mismo MySQL donde están las bases de datos. No tiene que ver con el servidor PHP desde el que se realice la conexión, así que no te preocupes. Ese usuario le servirá a tu Moodle, tanto ahora como si más tarde separas la parte PHP de la parte MySQL.
Saludos.