Saludos Enrique.
Yo tuve el mismo error al trabajar en la actualización de Moodle 2.6.4 a 3.5, en el paso previo de actualizar de la v2.6.4 a v2.7.11.
Debug info: can not rename table
Error code: ddltablealreadyexists
Error code: ddltablealreadyexists
Stack trace:
Lo que hice para resolver este problema fue subir de la v2.6.4 a la v2.6.11+ y luego pude subir a la versión 2.7.11 ya sin este problema. - line 512 of /lib/ddl/database_manager.php: ddl_exception thrown
- line 2291 of /lib/db/upgrade.php: call to database_manager->rename_table()
- line 1790 of /lib/upgradelib.php: call to xmldb_main_upgrade()
- line 518 of /admin/index.php: call to upgrade_core()
Talvez primero actualizando a una versión previa a la 3.4 se podrá solucionar este inconveniente.