Hola Marta,
Es posible que no estés utilizando la 'actividad' correcta.
Las preguntas de cuestionario están pensadas para ser contestadas en una única sesión, con una o varias oportunidades más, etc...
Sin embargo, para lo que tú planteas, quizá encajaría mejor la actividad 'tarea'. Las tareas también se califican.
Si tuvieran que ser tipo preguntas, quizá en vez de hacer una actividad con muchas preguntas, podrías crear un 'banco de preguntas' (quizá por temas) y conforme vayan avanzando los alumnos les planteas el desarrollo de un cuestionario más corto.
Podrías echar un vistazo a esta documentación, a fin de escoger la actividad más idónea:
https://docs.moodle.org/all/es/Actividades
https://docs.moodle.org/all/es/Preguntas
https://docs.moodle.org/all/es/Guía_rápida_del_profesor
Saludos.
JP