Hola Lluís,
1.- Sería convenient que el penjesis tot, que sinó ja me diras com t'apanyes per sols penjar una part? (Com a paquet entenc el zip o gz)
2.- No, primer de tot has de fer una còpia de seguretat, tant de /moodle, com les /moodledata. Així també te recomano que facis una copia de seguretat de la base de dades.
Tot això te servirà per si te peta la actualització i a la força has de donar servei, sempre te permetrà tornar enrera.
Una vegada feta la còpia de seguretat, descomprimeix el paquet moodle, i li has de dir que te substituesqui els arxius. (ves alerta, que si has introduit canvis als fonts, te desapareixeran).
Te conectes al site, i ell ja s'en dona compte que vos actualitzar, i així començarà la actualització.
3.- En principi sí, no tenc constància que ningú els hagi perduts quan ha realitzat a actualització. (per això tens la còpia de la base de dades)
4.- Tot no, però molta cosa sí. Som bastants els que hi dedicam esforços
Salutacions!