Desde mi punto de vista existen las siguientes opciones:
1. exportar las notas de cada curso a excel y luego sumarlas
2. generar una nueva funcionalidad de moodle, esto implica un desarrollo y programacion
3. crear un solo curso llamado educación física, y que "Fútbol", "Basquetbol", "Voleybol" y "Atletismo" sean temas del mismo curso, cada tema con su examen y así obtienes el total del curso educación física