Hola !!!
Si tu aumentas actividades y configuras tu item de calificaciones para que a demás de las que tienes sume también estas, lógicamente aumentara el porcentaje final total para todos los alumnos.
Mi recomendación de seria, que en un bloque independiente dentro de tu item de calificaciones pongas y ordenes las nuevas actividades poniéndoles un nombre, por ejemplo actividades de recuperación:
foro Nº 1= 15 puntos
cuestionario Nº 1 =25 puntos
cuestionario Nº2=25 puntos
tarea Nº1=35 puntos
total =100 puntos
Al termino de este bloque o item de calificación independiente, te arrojara la suma total de las calificaciones obtenidas en este item, así no te confundirás con los alumnos que aprobaron normalmente y los que tuvieron que realizar las actividades de recuperación.
Coméntanos como te fue.
Saludos.