"...scheint es uns notwendig, dass Inhalte die nur für eine bestimmte Gruppe bestimmt sind, auch nur von dieser zu sehen sein sollten"
Also ich würde mir da eine grundsätzlich andere Kursstruktur überlegen...
Z.B. :
Alles, was alle Grupen/Klassen bearbeiten kommt in einen Kurs. Hier gibt es Trainer mit Bearbeitungsrecht, die den Kurs pflegen und eben Trainer ohne Bearbeitungsrecht.
Alles was gruppenspezifisch ist, kommt in einen anderen Kurs in den auch nur die Mitglieder der entsprechenden Gruppe eingeschrieben sind. Hier ist der Kurs-/Gruppe-/Klassenleiter Trainer mit Bearbeitungsrecht und kann gruppenspezifische Aktivitäten/Materialien bereitstellen.
Jetzt könnte man noch überlegen, dass die gruppenspezifischen Kurse per Metaeinschreibung in die gemeinsamen Kurse aufgenommen werden. Es gibt ein Plugin, dass dann in einem allgemeinen Kurs die jeweils meta-eingeschriebenen Kurse in eine Gruppe abbildet.