Non, je ne dirais pas qu'il y a un problème puisque dans les deux cas le menu burger traite les mêmes éléments qu'un thème "standard", à savoir les items du menu personnalisé commun à tous les thèmes.
Par contre l'affichage de ces items (auxquels peuvent s'ajouter d'autres options) n'est pas localisé au même emplacement, en haut à droite en standard, en bas à gauche pour adaptable.
Si vous n'utilisez pas les menus spécifiques "adaptable" mais uniquement le menu personnalisé Moodle alors le comportement reste cohérent avec ce que vous souhaitez faire.
Reste qu'une fonctionnalité de burguerisation des menus spécifiques adaptable serait peut-être un plus sachant qu'alors on pourrait se trouver avec deux burgers (un pour le personnalisé, l'autre pour le spécifique) ce qui risque d'instaurer un trouble pour l'utilisateur.
Vous pouvez également altérer le code d'adaptable pour afficher le menu personnalisé au droit (mais à gauche) du menu utilisateur, mais alors cette modification serait à reporter à chaque mise à jour du thème.
Jérôme.