Olá Jaqueline, existe uma opção chamada "Agregar somente notas dadas". Ao clicar na interrogação a seguinte informação é dada: "Notas não dadas são aquelas que não estão no livro de notas. Pode ser de uma atividade que ainda não foi avaliada ou um quiz que ainda não foi tentado. Esta configuração determina se notas não dadas não são incluídas na agregação ou se serão contabilizadas como nota mínima, por exemplo, como 0 em uma atividade que pode ser avaliada entre 0 e 100."
Então, para seu caso, acredito que você precise desmarcar essa opção para que o moodle considere as atividades não realizadas.
