Saludos
Hay diversos clientes de SQL que te permiten hacer consultas a la base de datos y te devuelven los resultados en diversos formatos entre ellos excel.
Por otro lado si lo descargas en TXT y posteriormente lo abres en excel no debe de haber problema alguno
Me parece que el problema desde el LMS es que los tiempos de ejecución son muy elevados para la generación del archivo de excel y por eso, como dices tú, truena. Haz probado incrementar valores en tiempo, buffer, memoria??
Por otro lado no lo intentes hacer desde un IE ya que tendrás mas problemas intenta con Chrome o Firefox
Cuéntanos como te fue por favor.
Bye