Аналогичная ситуация.
Moodle 3.0.1, Windows Server 2012R2 + IIS + PHP + SQL Server 2014
25 вопросов, 1500 авторизованных ответивших.
При нажатии на кнопку экспортирования, страница показывает, что идет какой-то процесс, а топом просто отображается пустая страница.
Помогла установка большего значения параметра max_execution_time до 6000 в php.ini (а не 300 как советовалось по ссылке MDL-37132).
В итоге процесс выгрузки длится около 10-15 минут, а потом всё-таки появляется долгожданный файл xls. Главное дождаться
Пробовала установить девелоперствую версию 3.1, там еще это не исправили, но работа, как я понимаю, идет. Вроде какой-то другой алгоритм выгрузки хотят применять.