Hola Marisa
Por qué no intenta reparar las tablas? Es probable que alguna esté corrupta en algún sitio y esto le genere inconvenientes. Esto lo consigue con la instrucción repair table [nombre_tabla]. Esto debería hacerlo con todas las tablas de la base de datos. Es solo una idea que espero pueda solucionar su inconveniente.
Cordial saludo;
Francisco Forero G.
Bogotá, Col.