Hola
a ver si esto nos puede ayudar,
localizamos en theme/my_theme/config.php
$THEME->layouts = array(
...
// Main course page.
'course' => array(
'file' => 'mycourses.php', // este será el layout que cargue en la vista course
'regions' => array('side-pre'),
'defaultregion' => 'side-pre',
'options' => array('langmenu'=>true),
),
Entonces actualizamos theme/my_theme/layout/mycourses.php, por ejemplo
...
<?php echo $OUTPUT->standard_top_of_body_html() ?>
<?php require('header.php'); ?>
<?php echo $course->fullname ?>
...
Saludos!