L'aggiornamento di una versione "core" di Moodle all'interno dello stesso ramo stabile, ad esempio 2.4, è una operazione piuttosto semplice che se condotta correttamente è difficile che possa creare problemi. Le precauzioni da prendere sono quelle di qualsiasi aggiornamento, in particolare la possibilità di poter ripristinare il backup e la possibilità di provare su un sito di test. Particolare attenzione al ripristino, eseguire un backup può non significare necessariamente riuscire a ripristinare se la procedura di backup e ripristino non è stata provata e consolidata.
Discorso a parte va fatto per eventuali modifiche del codice "core" o per l'utilizzo di plugin che non fanno parte della distribuzione ufficiale di Moodle - plugin "contrib" ognuno dei quali è una storia a sé -, elementi per i quali dovrai svolgere le opportune verifiche prima di ogni aggiornamento.
Per una panoramica generale sugli aggiornamenti: http://docs.moodle.org/26/en/Upgrading