Да, некоторые галки были сняты. Но, по идее же, если они нужны, то их можно добавить их при резервном копировании конкретного курса?
Как же их можно добавить, если Админ отключил эту возможность на уровне сайта, сняв галку, допустим, с "Включать элементы курса"? Если включить, то у преподавателя будет возможность выбрать/не_выбрать элементы курса для включения в бекап. А, если админ ещё поставит галку "Заблокировать", то у преп-ля и возможности выбирать не будет. Вот такой механизм.
Подумайте, зачем бы делали в админке эти галки, если бы, не смотря на настройки в админке, преп-ль мог управлять выбором в курсе? 