Xavi
Por lo que he probado de moodle 1.9, no importa la zona horaria del usuario, el sistema recalcula el horario de acuerdo a la hora que configuras la actividad. Por ello, no deberías encontrar inconsistencias.
Por ejemplo, si una actividad está marcada para las 21:42 en hora Argentina, un usuario de la zona de Africa / Malabo (Guinea Ecuatorial) verá la actividad como programada para la 01:42 del día siguiente.
Saludos
Eder