Hola Fabian:
Esta configuración tiene varias posibilidades y creo que si la Intranet tienes acceso a Internet, que por lo que comentas asi es, solo deberias editar config.php el block de notas y en la siguiente linea poner:
$CFG->wwwroot = 'http://www.tudominiocontratado.com;
De esta forma cualquier maquina de la intranet (que tenga acceso a Internet), y tipeando http://www.tudominiocontratado.com podrán acceder a Moodle.
Ni que decirte, que http://www.tudominiocontratado.com lo debes de cambiar por el tuyo..jeje
Bien, eso por un lado y comentando el tema de los Sistemas Operativos Windows que te ofrecen mayor rendimiento que Vista como de aqui a Pekin, podríamos enunciar los siguientes:
Windows Server 2003 : Instalación y configuración paso a paso.
Jorge orlando aseguró en un post que: ... Windows 2003 server sp2, sql server express 2005, iis 6.0, php 5.2+, moodle 1.8.3.. funciona perfecto...
como tienes licencia original, en www.microsoft.com puedes encontrar la version de sql server express 2005 y su interfaz de administracion grafica.
Despues de que la solucion de bases de datos este funcionando, instala php agregando y configurando el archivo freetds.conf(lo puedes bajar de internet). No se le olvide configurar IIS para utilizar coneccions ISAPI con php. Prueba la coneccion y cuando este funcionando instala moodle..
La documentacion en ingles esta mejor diseñada y tiene enlaces a las paginas que necesitas para configurar tanto IIS como PHP...
Hice un instructivo pero en este momento no lo encuentro... cuando lo tenga con mucho gusto lo colgare en el foro...
cualquier inquietud con gusto tratare de resolverla..
Si dominas el idioma ingles, aqui tienes una buena guia explicativa: 
Las versiones de Windows Server va por la 2008, pero no se si hay mucha información al respecto. Esperemos posteen aquellos que mantiene sitios con este sistema operativo.
Las criticas a Windows 2008 son buenas...tanto que muchas personas lo usan como versión desktop. He aqui un comentario al respecto.
Y aqui un video de instalación.
Bueno, hay queda eso. Ya nos cuentas ¿eh?
Saludos, Jorge