大した実害は無いのですが，エラーメッセージの表示をONにしていると，コースにリソース（ファイル・フォルダへのリンク）を追加するたびに警告が出るので．これはMoodle1.9以降のみで発生します．
mod/resource/type/file/resource.class.phpのfunction _postprocess()
function _postprocess(&$resource) {
global $RESOURCE_WINDOW_OPTIONS;
$alloptions = $RESOURCE_WINDOW_OPTIONS;
// (Shirai071): ここから修正
// if ($resource->forcedownload) {
if (isset($resource->forcedownload) && $resource->forcedownload) {
// (Shirai071): ここまで修正
$resource->options = 'forcedownload';
} else if ($resource->windowpopup) {
強制ダウンロードするかどうか，設定画面（display()）で設定できるのですが，新しいウィンドウに表示する設定(windowpopup)にすると，強制的にダウンロードさせる，はチェックボックスがグレーになります（無効化）．つまりこの場合は$resource->forcedownloadが設定されませんので，falseでもtrueでも無く，そのため警告が表示されます．
MDL-15219に報告済みです．
と，よく調べてみたら， MDL-14895で報告済みですね．