Hola Oscar...
He tenido el mismo problema y acabo de postear en otro foro la solución que me han pasado esta tarde...
Existe un fichero php el bigdump que te permite subir bases de datos inmensas a phpmyadmin. Hoy mismo hemos subido la información y la posibilidad de descargarlo en
http://avanzosc.com/moodle/course/view.php?id=12
Y el link al otro post(que creo que también es tuyo) es:
http://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=79512#p353004
Saludos!!!