いろいろな意味で使われていますので「貢献」という言葉の定義が難しいですが、
下記の3つにより、今後のMoodleに対して何らかの手助けができると思います。
1. 寄付
http://moodle.org/donations/
2. モジュール・プラグインを独自に開発して公開する
http://moodle.org/mod/data/view.php?id=6009
3. テーマ開発を独自に開発して公開する
http://moodle.org/mod/data/view.php?id=6552
> Moodleをカスタマイズした場合に公開しなければならないこと
おそらく下記ページの「2. Source Code」のことだと思います。
http://www.opensource.org/docs/definition.html
これは「公開自由ですけど、公開するときはカスタマイズしたソースコードも一緒に公開してくださいね」ということだと思います。ですから「カスタマイズしたら必ず公開すべき」ということではないと思います。
> 他に、注意事項がございましたら、よろしくお願いいたします。
今日のMoodle 1.6.4+ と明日のMoodle 1.6.4+ は微妙に違う場合もありますので、誤動作やトラブルを防ぐため、常に最新の状態にMoodleを更新することが必要だと思います。