Cesar,
Na realidade você não faz acesso ftp ao Moodle e sim ao servidor web em que o Moodle está instalado. Isso significa que você deve ter uma conta, com usuário e senha, de acesso ao servidor. Muito provavelmente o nome do servidor ftp deve ser ftp://ftp.ccems.pt . Quem pode te responder essa questão com certeza é o administrador do servidor web em que o Moodle está instalado, pois mesmo sabendo o nome do servidor ftp, você precisar conhecer o usuário e senha.
Quanto a mudar o logotipo do cabeçalho, isso pode ser simples se o tema selecionado contiver um logo, senão será um pouco mais complicado. De qualquer modo as informações do cabeçalho estão no diretório [raiz-moodle]/theme/[nome-do-tema-ativo]. O conteúdo desse diretório pode variar de tema para tema, mas ele deve conter um header.html, que descreve o cabeçalho, incluindo o nome do arquivo que representa o logo, que pode ser header_logo.jpg, por exemplo. Alterando esse arquivo, o logo será alterado.
Edgar Amorim