Hola Ginés,
o mucho me equivoco o lo que comentas no se puede. Cuando defines en un curso (o en una actividad) que va a funcionar con grupos, como mucho puedes especificar si los grupos se van a ver entre sí o no. De esta forma, en un foro, por ejemplo, cada grupo tendrá sus propias discusiones de tal forma que, si se desea, estarán competamente aisladas.
Pero todas las actividades están disponibles para todos los grupos. Si se quieren definir grupos de alumnos accediendo a diferentes actividades, no queda otro remedio que definir cursos disitntos.
Ciao