Добрый день. Пока искал куда делось место на хостинге нашел ссылки на самые большие файлы в mdl_files, но когда сунулся в moodledata\filedir там их уже не было.
Оказалось предыдущий админ столкнувшись с проблемой нехватки места просто удалил файлы moodledata\filedir не потерев при этом ссылки в базе.
Может есть способ выровнять записи БД?