На Ubuntu должно быть веселей, да и по тесту видно, где «затык», хотя всё и зелененькое 
Нужно с дисковой подсистемой что-то делать, чтобы снизить время на создание/чтение файлов, одновременно и время загрузки уменьшится, и время чтения курса.
Смотрите тут конфиги и результаты: https://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=335357
Базу данных желательно на SSD (при наличии финансов - рейд 0 из SSD), moodledata - можно на рейд 0 из HDD, и обязательно настроить резервное копирование БД и moodledata на другой диск (внешний носитель). А если финансы позволяют - создавайте рейды 5, 10
Нужно с дисковой подсистемой что-то делать, чтобы снизить время на создание/чтение файлов, одновременно и время загрузки уменьшится, и время чтения курса.
Смотрите тут конфиги и результаты: https://moodle.org/mod/forum/discuss.php?d=335357
Базу данных желательно на SSD (при наличии финансов - рейд 0 из SSD), moodledata - можно на рейд 0 из HDD, и обязательно настроить резервное копирование БД и moodledata на другой диск (внешний носитель). А если финансы позволяют - создавайте рейды 5, 10