Для увеличения объема загружаемого файла в moodle создал в корне мудл файл php.ini с текстом:
php не читает настройки из левых каталогов.
Список каталогов из которых php берет настройки можно посмотреть в "Информации о php" в Администрировании->Сервер
apache может читать файл .htaccess, но только при условии, что в каталогах разрешено перекрывать настройки.
Инструкций на тему изменения параметров php в варианте apache+mod_php огромное число, на любой уровень знаний. Воспользуйтесь поисковиком.