Ja też obstawiam uruchomienie nowej wersji. Aktualizacja od Moodla 1.9 do najnowszej jest możliwa, ale pojawia się cały szereg problemów i jest pracochłonne (choćby z tego powodu, że po drodze trzeba wykonać pewnie z 5-6 kolejnych aktualizacji...). Jest niezła jazda z dodatkami (w tym z szablonami) oraz konfiguracją bazy danych (jak pisał boruh compl), do tego trzeba po kolei zmieniać wersje PHP (Moodle w określonej wersji nie może mieć ani zbyt wysokiej, ani zbyt niskiej wersji PHP).
Dużo lepiej jest uruchomić najnowszą wersję i ewentualnie pokusić się o przeniesienie kont użytkowników.