В модуле Электронный деканат тоже реализовано разделение пользователей по подразделением и есть возможность дать права только на пользователей определенного подразделения. Все пользователи синхронизируются в Moodle, а при подписке на курсы - тьютор добавляется в них в качестве преподавателя. Так что в комплексе, это реализует как раз требуемый функционал.