есть плагины для работы с формулами, например, от wiris, возможно что-то из этого можно будет применить и у вас
есть плагины для перетаскивания на изображение. Вы делаете картинку с клеточками на которые нужно будет перетаскивать элементы.
Делаете картинки с элементами, которые нужно перетащить - в качестве картинок можете использовать всё, что угодно, и обычные символы, и символы с ударениями, и символы фонетического алфавита, и символы в индексах, как фантазия развернется. Кроме этого накидаете в вопрос символы, которых нет в ответе. И студент будет должен как из кассы букв и слогов перетаскиванием на клеточки составить ответ